امنيت عمومى بازجويى شد و مورد انواع شكنجه‌هاى جسمى و روحى گرفت كه حتى در سياه‌ترين صفحات تاريخ طواغيت و جنايتكاران نيز نمونه آن را كمتر مىتوان يافت . وى سرانجام پس از مدتى با قرار ممنوعيت از سفر و هرگونه فعاليت دينى و فرهنگى از زندان آزاد شد . خروج از عراق پس از پيروزى انقلاب اسلامى ايران تظاهرات گسترده‌اى در شهرهاى عراق خصوصاً در نجف اشرف در تأييد انقلاب اسلامى و رهبر آن امام خمينى برگزار شد . رژيم صدام - طبق اظهارات رئيس اداره امنيت عمومى - آيت‌اللَّه هاشمى شاهرودى را به عنوان محرّك و مشوّق اين تظاهرات متهم كرد و قرار دستگيرى او از سوى اداره امنيت عمومى صادر شد ، مأموران امنيتى جستجوى گسترده‌اى را براى دستگيرى وى آغاز كردند . در اين شرايط شهيد صدر از او خواست كه فوراً از عراق خارج شود . او ابتدا به كويت رفت و از آنجا به ايران مهاجرت كرد . در پى ناكامى دستگاه‌هاى امنيتى از دستگيرى ايشان ، رژيم صدام سه برادر وى را دستگير و اعدام كرد كه حتى جنازه آنان نيز تاكنون به دست نيامد .